Родился 8 октября 1962 года. Кандидат филологических наук. Окончил Московский государственный университет им.М.В.Ломоносова, аспирантуру МГУ.
Работал старшим преподавателем Казахского государственного университета им.С.М.Кирова, парламентским обозревателем, заведующим отделом редакции газеты "Советы Казахстана", в сфере предпринимательства. В 1996-2005 гг. - первый секретарь пресс-службы МИД; завотделом информации и прессы МИД, завсектором пресс-службы президента РК; заместитель руководителя пресс-службы президента РК, советник, советник-посланник посольства РК в РФ, полномочный представитель РК при ОДКБ, первый вице-министр культуры, информации и спорта РК. В 2006- 2008 гг.- заведующий информационно-аналитическим центром администрации президента РК, пресс-секретарь президента РК. С августа 2008 г. - председатель правления государственного холдинга "Арна-Медиа". В 2009 г. назначен управляющим директором АО "Самрук-Казына".
Кайсар Жанаханов освобожден от должности гендиректора холдинга "Нур Медиа" в связи с переходом на другую работу.